国家体育总局深入学习实践科学发展观活动启动以来，各单位按照中央和总局学习实践活动领导小组统一部署，有计划、有步骤地认真开展学习实践活动，并结合本单位本项目实际，明确提出了在学习实践活动中深入思考并着力解决的突出问题。
    服务中心提出要深入思考和着力解决党员干部特别是领导干部不适应不符合科学发展的思想观念；如何进一步建立、完善影响和制约机关后勤服务事业发展的体制机制问题，在后勤保障工作中自觉实践科学发展观，不断提升机关后勤服务水平，促进总局机关和中心内部和谐建设。
    射运中心提出要围绕北京奥运会后射击射箭项目的可持续发展、协会建设、中心管理体制改革、体育产业推进以及承担社会公共责任等问题进行深入研究思考。
    自剑中心提出要深入研究思考中心所管的5个运动项目可持续发展的问题，用辩证观点透视规律的变化，解决存在的问题和矛盾；在中心体育产业发展问题，要从生存与发展的角度思考，进一步做好场馆设施的开发利用，使固定资产转化为经济效益，研究创新体育产业的理论与实践，探索场馆运营的有效模式；在开展群众性体育活动问题，要按照科学发展观的核心是以人为本的要求，着力思考竞技体育与开展群体活动如何统筹兼顾的问题。
    登山中心提出要研究思考登山运动与登山户外产业的关系；登山运动与提高人民健康素质及生活质量的关系；登山运动与推动地方经济、社会、旅游、消费的关系；登山运动的社会效益与经济效益的关系。研究解决如何进一步加强中心领导班子建设；进一步加强登山队伍建设；加强团队建设，实行科学分配机制，充分调动干部职工的积极性、创造性；组织好重大赛事及活动，发挥其在登山户外运动的龙头作用；关心干部职工身体健康和生活福利待遇，加强离退休干部职工工作。
    科研所提出要认真思考如何坚持立足行业、面向全国，加强自主创新，更好地发挥自身优势；如何把握和解决体育事业改革与发展中遇到的具有全局性、战略性的重大体育科技问题，为提高国民身体素质、提高我国竞技体育的国际竞争力提供科技支持，带动全行业的知识创新和科技进步；如何切实加强规划、制度和人才队伍建设，打造核心竞争力，全面提升科学发展、和谐发展的能力和实力，把体科所建成世界一流的现代化体育科学研究机构。
    运医所提出要深入研究思考北京奥运会后运医所应如何实现全面协调可持续发展；如何制定今后5年乃至10年的长远发展规划；在运动医学和运动营养的临床、科研、服务等方面如何达到全国的领先地位；制约当前运医所发展的最突出问题；如何利用保障国家队的工作优势带动运医所特色医疗事业发展和运动营养品牌的开发；内设各处室、科室之间如何密切配合、团结协作，实现全面发展；查找为国家队服务存在哪些不足，如何改进，等等。
    反兴奋剂中心提出要认真思考和着力解决关于充分发挥反兴奋剂中心的职能作用问题；关于跳出体育“兴奋剂”，打击社会市场“兴奋剂”问题；关于反兴奋剂中心的可持续发展问题；充分认识赛风赛纪和反兴奋剂工作常抓不懈的重要意义。
    文化发展中心提出要认真思考和解决在体育文化工作中如何按照IOC的有关规定，中心代表中国奥委会接受北京奥组委移交的一系列文化遗产；如何实现中国体育博物馆新馆尽快立项，并尽早落实总局领导关于“一馆两名”的批示精神；如何尽快征集中国体育健儿在奥运会等世界三大赛事中的冠军装备和奖杯，并使此项工作制度化、规范化。
    中体产业公司提出要认真思考和着力解决公司治理规范运作问题；公司的战略发展方向问题；积极应对宏观调控，做好目前的房地产主业；积极探索体育场馆运营的有效模式；继续加强内部管理，抓好控制成本核算，加强金融监管，拓宽融资渠道，防范金融风险；大力培养“两干、两创、两顾”的经营管理人才问题。