为了深入做好先进性教育活动整改提高阶段的工作，确保先进性教育活动成为群众满意工程，经学校党政联席会议研究，制定了校党委和学校先进性教育活动整改方案。
整改方案确立了“坚持开门办教育，围绕学校发展的主题，切实解决党委和领导班子在党建、思想、工作、作风、自身建设和领导能力等方面存在的问题。进一步加强基层组织建设、发挥党员的先进作用，以整改为契机，推动学校各项工作的顺利发展”的指导思想。整改内容包括：党建方面的整改；工作方面的整改；作风方面的整改；班子自身建设方面的整改。要求在政治上提高战斗力，在思想上增强凝聚力，在工作上发挥创造力，在经济上发展生产力，在廉政上增强免疫力。确定从以下四个方面提出整改措施：
一、加强党建工作。要按规定程序完成党委换届工作；规范落实各项党建制度；加强对支部工作的指导和监督；加大党员教育培训力度；落实民主评议党员和党员评先制度；加强对离退休老同志工作的领导。
二、加强学校工作。要围绕发展抓整改；要处理好“合资公司”的有效监管问题；要抓好飞行及专业技术队伍建设，探索制定出一条符合学校发展的人才队伍培养管理途径和机制；要加快人事制度改革和分配制度改革，制定全员聘任制改革方案；要按照“四位一体”模式，制定好学校的长远发展规划；要加强对无形资产的利用和保护。
三、转变作风、务求整改实效。实行责任制度，在工作实效上下工夫。
四、加强各级领导班子自身能力建设。进一步加强学习；加强民主集中制的建设；加强对学校发展战略和长远规划的研究；关心学校职工群众的切身利益，努力构建“和谐校园”。
学校制定了整改事项目标责任一览表。凡涉及全局性的问题，主要领导为第一责任人，分管领导为具体责任人，部门领导为直接责任人；凡属学校职权范围内的问题，要参照方案，在第一责任人的安排下，由具体责任人按时限组织有关科室进行整改；要逐级建立整改工作日程，实行整改销号制度，确保每一项整改内容的扎实落实。
通过系统的整改，真正让群众得到实实在在的利益，看到党员和党组织在先进性教育活动中的新变化、新面貌、新形象，感受到先进性教育活动取得的实际效果。